Terverifikasi Administratif dan Faktual oleh Dewan Pers
Yokohama F. Marinos adalah hasil dari merger dua klub Liga Utama Jepang dari sesama klub Yokohama antara Yokohama Marinos dan Yokohama Flugels.
Kala itu Yokohama Marinos menawarkan Yokohama Flugels yang tengah terancam bangkrut untuk merger pada 1999.
Yokohama Marinos punya posisi yang lebih kuat sehingga Yokohama Flugels tak bisa menolak sehingga terealisasi lah merger kedua klub ini.
Yokohama Marinos punya daya tawar yang lebih besar karena mereka tak semalang Yokohama Flugels yang tengah dilanda krisis keuangan.
Mereka ditawari untuk merger demi menjaga identitas Flugels untuk tetap bermain di kasta tertinggi sepak bola Jepang.
Salah satu bentuk kerja sama merger kedua klub ini adalah berpindahnya pemain-pemain dari Yokohama Flugels ke ke Yokohama Marinos.
Nama baru pun muncul yakni Yokohama F. Marinos, dimana 'F' di sana merupakan representasi dari Flugels.
Tak setuju dengan konsep tersebut, fans dari Yokohama Flugels pun mendirikan klub baru bernama Yokohama FC.
Meski bermain di kasta kedua Jepang atau J2 League, Yokohama FC menjadi salah satu klub Jepang paling dikenal karena diperkuat legenda hidup sekaligus pemain sepak bola tertua di dunia yakni Kazuyoshi Miura.