Sementara itu, Marc Marquez yang membela Gresini Racing tertahan di urutan keempat di belakang rekan setim sekaligus adiknya, Alex Marquez.
Dengan lintasan sepi karena sebagian rider kembali ke paddock, Bagnaia berupaya mengejar catatan waktu milik Martin yang menjadi rekor baru Assen.
Upaya tersebut membuahkan hasil, juara bertahan MotoGP dalam dua musim terakhir itu melewati catatan Martin dengan 1 menit 30,540 detik.
Di Giannantonio berhasil memecah duo Marquez dengan menduduki urutan ketiga melalui gap 0,7 detiknya dari Bagnaia.
Marquez mengalami nasib sial di menit terakhr Q2 dengan jatuh terlempar ke gravel tikungan 7 yang sebelumnya memakan korban pada FP2.
Tikungan 7 menjadi sorotan setelah sempat red flag berkibar pada FP2 karena gravel terlempar karena kecelakan Bezzecchi dan Raul Fernandez.
Mendapatkan ancaman dari Martin, Bagnaia masih mampu menjaga posisinya saat bendera finis berkibar untuk menduduki pole position dengan keunggulan 0,081 detik.
HASIL KUALIFIKASI MOTOGP BELANDA 2024
Kualifikasi 2
1. Francesco Bagnaia (Ducati) 1:30.540
2. Jorge Martin (Pramac Racing) +0.081
3. Maverick Vinales (Aprilia) +0.411
4. Alex Marquez (Gresini Racing +0.439
5. Aleix Espargaro (Aprilia) +0.537
6. Fabio Di Giannantonio (Pertamina Enduro VR46 Racing Team) +0.734
7. Marc Marquez (Gresini Racing) +0.838
8. Franco Morbidelli (Pramac Racing) +0.865
9. Brad Binder (Red Bull KTM) +0.939
10. Pedro Acosta (GASGAS Tech3) +0.942
11. Enea Bastianini (Ducati) +1.088
12. Raul Fernandez (Trackhouse Racing) +1.388
Kualifikasi 1
1. Pedro Acosta (GASGAS Tech3) 1:31.372*
2. Fabio Di Giannantonio (Pertamina Enduro VR46 Racing Team) +0.018*
3. Fabio Quartararo (Monster Energy Yamaha) +0.248
4. Jack Miller (Red Bull KTM) +0.531
5. Marco Bezzecchi (Pertamina Enduro VR46 Racing Team) +0.625
6. Alex Rins (Monster Energy Yamaha) +0.736
7. Miguel Oliveira (Trackhouse Racing) +0.751
8. Lorenzo Savadori (Aprilia) +0.871
9. Johann Zarco (LCR Honda) +0.888
10. Joan Mir (Repsol Honda) +1.125
11. Luca Marini (Repsol Honda) +1.255
12. Augusto Fernandez (GASGAS Tech3) +1.297
13. Takaaki Nakagami (LCR Honda) +1.658
*) lolos Q2