Terverifikasi Administratif dan Faktual oleh Dewan Pers
Martin lah yang akhirnya menorehkan catatan waktu tercepat untuk sementara dengan 1 menit 29,088 detik, rekor baru MotoGP.
Dua pembalap motor Jepang, Johann Zarco dan Fabio Quartararo (Monster Energy Yamaha) tampil mengejutkan dengan berada di posisi tiga besar pada run pertama.
Hingga paruh sesi, posisi start di baris terdepan untuk sementara ditempati Martin, Zarco, dan Marco Bezzecchi (Pertamina Enduro VR46).
Adapun Francesco Bagnaia (Ducati Lenovo) dan Marc Marquez masih menghuni dua posisi terbawah sampai run pertama selesai.
Run kedua dimulai, nasib apes kembali dialami Marquez yang untuk kedua kalinya terjatuh pada Q2 MotoGP Indonesia 2024.
Marquez terjatuh di Tikungan 10 saat sedang membuntuti Bagnaia. Sementara Bagnaia, sang juara bertahan GP Indonesia berhasil merangsek naik ke posisi tiga besar.
Frustrasi tampak di paddock Gresini Racing setelah Marquez tak dapat melanjutkan sesi kualifikasi dan akan start dari grid ke-12 setelah sama sekali gagal mencatatkan waktu lap.
Di depan, tak ada yang berhasil melampaui torehan waktu milik Martin yang dicatatkan sejak run pertama.
HASIL KUALIFIKASI MOTOGP INDONESIA 2024
| Pos. | Pembalap | Tim | Waktu |
| 1 | Jorge Martin | Prima Pramac Racing | 1:29.088 |
| 2 | Marco Bezzecchi | Pertamina Enduro VR46 | 1:29.623 |
| 3 | Pedro Acosta | Red Bull GasGas Tech3 | 1:29.671 |
| 4 | Francesco Bagnaia | Ducati Lenovo | 1:29.745 |
| 5 | Enea Bastianini | Ducati Lenovo | 1:29.792 |
| 6 | Fabio Quartararo | Monster Energy Yamaha | 1:29.848 |
| 7 | Johann Zarco | LCR Honda | 1:29.942 |
| 8 | Fabio Di Giannantonio | Pertamina Enduro VR46 | 1:29.963 |
| 9 | Franco Morbidelli | Prima Pramac Racing | 1:30.107 |
| 10 | Maverick Vinales | Aprilia Racing | 1:30.418 |
| 11 | Raul Fernandez | Trackhouse Racing | 1:30.524 |
| 12 | Marc Marquez | Gresini Racing | - |
| Tidak Lolos dari Kualifikasi 1 | |||
| 13 | Aleix Espargaro | Aprilia Racing | 1:30.110 |
| 14 | Alex Marquez | Gresini Racing | 1:30.243 |
| 15 | Alex Rins | Monster Energy Yamaha | 1:30.293 |
| 16 | Jack Miller | Red Bull KTM | 1:30.385 |
| 17 | Luca Marini | Repsol Honda | 1:30.395 |
| 18 | Takaaki Nakagami | LCR Honda | 1:30.430 |
| 19 | Brad Binder | Red Bull KTM | 1:30.582 |
| 20 | Joan Mir | Repsol Honda | 1:30.698 |
| 21 | Augusto Fernandez | Red Bull GasGas Tech3 | 1:31.086 |